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培养基过滤灭菌和培养基过滤是两个相关但不同的概念。
培养基过滤主要是为了去除培养基中的杂质和不纯物质，以确保微生物生长的环境纯净，这一步通常使用过滤器进行，可以是简单的棉塞过滤或更为精细的膜过滤，过滤可以去除如细菌、酵母等微生物以外的物质，确保微生物在纯净的环境中生长，这种过滤过程本身并不具有灭菌作用。
而培养基过滤灭菌是通过过滤过程达到灭菌的目的，这种方法是使用特定的过滤系统，如深层过滤或膜过滤，来去除培养基中的活微生物，从而达到无菌状态，这种过滤灭菌方法常用于那些不耐热或不能经受高温蒸汽灭菌的培养基，通过过滤，可以去除包括细菌、病毒、真菌等在内的几乎所有微生物，确保培养基的无菌状态。
培养基过滤主要是为了提纯，而培养基过滤灭菌则是为了消除培养基中的所有活微生物，两者虽然都涉及过滤这一操作，但目的和效果不同。